Реагенты для подготовки NGS-библиотек
Комплексные решения для подготовки NGS-библиотек
Подготовка РНК-библиотек
| Hieff NGS MaxUp rRNA Depletion Kit (Plant) -12254ES |
NGS Library Preparation |
rRNA Depletion |
96 T |
12254ES96 |
|
| Hieff NGS Ultima Dual-mode RNA Library Prep Kit -12308ES |
NGS Library Preparation |
RNA Library Preparation |
96T |
12308ES96 |
|
| Hieff NGS Ultima Dual-mode mRNA Library Prep Kit (oligo dT magnetic beads plus) -12309ES |
NGS Library Preparation |
RNA Library Preparation |
96T |
12309ES96 |
|
| Hieff NGS Stubby UDI Primer Kit for Illumina, PE adapter plus, Set1 (001-096) -12327ES |
NGS Library Preparation |
UDI |
96x1 T |
12327ES01 |
|
| Hieff NGS DNA&RNA Library Co-Prep Kit V2 -12305ES |
NGS Library Preparation |
RNA Library Preparation |
96T |
12305ES96 |
|
| Hieff NGS One-Step rRNA Removal Kit (Human) _ 12258ES |
NGS Library Preparation |
rRNA Depletion |
96 T |
12726ES96 |
|
Подготовка ДНК-библиотек
| Hieff NGS Ultima Pro PCR Free DNA Library Prep Kit V2 -12196ES |
7367 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
8T |
12196ES08 |
|
| Hieff NGS Ultima Pro PCR Free DNA Library Prep Kit V2 -12196ES |
7367 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
24T |
12196ES24 |
|
| Hieff NGS Ultima Pro PCR Free DNA Library Prep Kit V2 -12196ES |
7367 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
96T |
12196ES96 |
|
| Hieff NGS DNA Library Prep Kit 2.0 (Mechanical) _ 12927ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
8T |
12927ES08 |
|
| Hieff NGS DNA Library Prep Kit 2.0 (Mechanical) _ 12927ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
24T |
12927ES24 |
|
| Hieff NGS DNA Library Prep Kit 2.0 (Mechanical) _ 12927ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
96T |
12927ES96 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina -12205ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
8T |
12205ES08 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina -12205ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
24T |
12205ES24 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina -12205ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
96T |
12205ES96 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit for Illumina -12205ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
500T |
12205ES97 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3 (Enzymatic) _ 12194ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
8 T |
12194ES08 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3 (Enzymatic) _ 12194ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
24 T |
12194ES24 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit V3 (Enzymatic) _ 12194ES |
7368 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
96 T |
12194ES96 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 (Enzymatic) -12972ES |
7362 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
8 T |
12972ES08 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 (Enzymatic) -12972ES |
7362 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
24 T |
12972ES24 |
|
| Hieff NGS OnePot Pro DNA Library Prep Kit V4 (Enzymatic) -12972ES |
7362 |
NGS Library Preparation |
DNA Library Preparation |
96 T |
12972ES96 |
|
Этапы подготовки NGS-библиотек
 NGS состоит из четырех этапов: предварительная обработка образцов, подготовка библиотеки, секвенирование и биоинформатическая обработка данных.
Предварительная подготовка образцов включает экстракцию нуклеиновых кислот и их очистку, также синтез кДНК (в случае работы с РНК) или эпигенетическую конвертацию.
- Реагенты для выделения и очистки ДНК
- Реагенты для выделения и очистки РНК
- Реагенты для синтеза кДНК
- Реагенты для эпигенетичской конвертации
Подготовка библиотеки является важным этапом, независимо от выбранного метода секвенирования.
Библиотеки секвенирования представляют собой набор фрагментов ДНК или РНК, отобранных по длине, с присоединенными к ним последовательностями - адаптерами. Процесс подготовки NGS-библиотек разделяют на несколько этапов.
1. Фрагментация
Фрагментацию длинных молекул ДНК до подходящего размера проводят с помощью физических или ферментативных методов. Ферментативные методы обычно предполагают применение эндонуклеаз рестрикции.
- Реагенты для фрагментации РНК
- Реагенты для фрагментации ДНК
2. Отбор фрагментов ДНК и РНК по длине
Отбор фрагментов ДНК и РНК по длине (size selection) — это важный этап подготовки библиотек перед секвенированием, от которого зависит точность и эффективность прочтения.
Неэффективное определение размера может привести к секвенированию низкомолекулярного материала, такого как праймерные димеры, и ухудшению качества данных.
- Реагенты для отбора фрагментов РНК и ДНК по длине
3. Лигирование адаптеров и циклизация молекул ДНК (для MGI)
К фрагментам необходимо лигировать адаптеры — технические последовательности, которые делают возможными манипуляции с молекулами ДНК. Перед этим проводят восстановление концов двунитевых молекул, чтобы на них не было однонитевых участков, фосфорилирование 5’-концов и аденилирование 3’-концов. Адаптеры обеспечивают прикрепление молекулы к поверхности твердой фазы, клональную амплификацию фрагмента и протекание реакции секвенирования.
Для работы на приборах MGI требуется циркуляризация NGS-библиотеки — из линейных фрагментов создаются кольцевые.
- Наборы для лигирования адаптеров Illumina
Производитель Yeasen bio предлагает наборы адаптеров для Illumina:
- Наборы для баркодирования MGI
- Реагенты для циклизации молекул ДНК
Производитель Yeasen bio также предлагает универсальные наборы для подготовки библиотек, которые могут быть адаптированы, как для Illumina, так и для MGI путем добавления необходимых адаптеров.
- Универсальные наборы для подготовки библиотек
4. Оценка качества библиотек
Оценка качества библиотек включает в себя точное определение количества ДНК/РНК, необходимое для правильного пулирования и загрузки в секвенатор, а также оценку количества молекул, которые несут адаптеры и способны прикрепиться к ячейке секвенатора.
- Реагенты для контроля качества библиотек
| 
