Реагенты для подготовки NGS-библиотек Yeasen

• Реагенты для TGS Yeasen
• Реагенты для контроля качества библиотек
• Реагенты для отбора фрагментов РНК и ДНК по длине
• Реагенты для подготовки библиотек Illumina
• Реагенты для подготовки библиотек MGI
• Реагенты для фрагментации НК
• Универсальные наборы для подготовки РНК-библиотек
• Ферменты и смеси для NGS

Комплексные решения для подготовки NGS-библиотек Yeasen

Производитель Yeasen предоставляет комплексные решения для подготовки РНК и ДНК библиотек:все этапы от фрагментации до лигирования адаптеров и контроля качества.

Подготовка РНК-библиотек 

Подготовка ДНК-библиотек

Этапы подготовки NGS-библиотек

NGS состоит из четырех этапов: предварительная обработка образцов, подготовка библиотеки, секвенирование и биоинформатическая обработка данных.

Предварительная подготовка образцов включает экстракцию нуклеиновых кислот и их очистку, также синтез кДНК (в случае работы с РНК) или эпигенетическую конвертацию.

- Реагенты для выделения и очистки ДНК

- Реагенты для выделения и очистки РНК

- Реагенты для синтеза кДНК

- Реагенты для эпигенетичской конвертации

Подготовка библиотеки является важным этапом, независимо от выбранного метода секвенирования.
Библиотеки секвенирования представляют собой набор фрагментов ДНК или РНК, отобранных по длине, с присоединенными к ним последовательностями - адаптерами. Процесс подготовки NGS-библиотек разделяют на несколько этапов.

1. Фрагментация

Фрагментацию длинных молекул ДНК до подходящего размера проводят с помощью физических или ферментативных методов. Ферментативные методы обычно предполагают применение эндонуклеаз рестрикции.

- Реагенты для фрагментации РНК

- Реагенты для фрагментации ДНК

2. Отбор фрагментов ДНК и РНК по длине

Отбор фрагментов ДНК и РНК по длине (size selection) — это важный этап подготовки библиотек перед секвенированием, от которого зависит точность и эффективность прочтения.

Неэффективное определение размера может привести к секвенированию низкомолекулярного материала, такого как праймерные димеры, и ухудшению качества данных. 

- Реагенты для отбора фрагментов РНК и ДНК по длине

3. Лигирование адаптеров и циклизация молекул ДНК (для MGI)

К фрагментам необходимо лигировать адаптеры — технические последовательности, которые делают возможными манипуляции с молекулами ДНК. Перед этим проводят восстановление концов двунитевых молекул, чтобы на них не было однонитевых участков, фосфорилирование 5’-концов и аденилирование 3’-концов. Адаптеры обеспечивают прикрепление молекулы к поверхности твердой фазы, клональную амплификацию фрагмента и протекание реакции секвенирования.

Производитель Yeasen bio предлагает наборы адаптеров для Illumina:

- Наборы для лигирования адаптеров Illumina

Для работы на приборах MGI требуется циркуляризация NGS-библиотеки — из линейных фрагментов создаются кольцевые.

- Наборы для баркодирования MGI

- Реагенты для циклизации молекул ДНК

Производитель Yeasen bio также предлагает универсальные наборы для подготовки библиотек, которые могут быть адаптированы, как для Illumina, так и для MGI путем добавления необходимых адаптеров.

- Универсальные наборы для подготовки библиотек

4. Оценка качества библиотек

Оценка качества библиотек  включает в себя точное определение количества ДНК/РНК, необходимое для правильного пулирования и загрузки в секвенатор, а также оценку количества молекул, которые несут адаптеры и способны прикрепиться к ячейке секвенатора.

- Реагенты для контроля качества библиотек