Реагенты для TGS Yeasen
Пробоподготовка к секвенированию третьего поколения (Oxford Nanopore, PacBio) требует выделения высокомолекулярной ДНК (HMW DNA). Главная задача — избежать разрывов нитей нуклеиновой кислоты, так как длина прочтений (ридов) является ключевым преимуществом этих технологий.
Ключевые требования к ДНК
Для получения максимальной длины ридов критически важно соблюдать следующие параметры:
- Длина фрагментов: От 10 до 100+ т.п.н.
- Чистота (коэффициенты): A₂₆₀ ÷ A₂₈₀ и A₂₆₀ ÷ A₂₃₀ должны быть строго в диапазоне 1,8–2,0, должны быть удаленены ингибиторы (полифенолы, полисахариды).
- Отсутствие деградации: Использование свежих или немедленно замороженных (жидким азотом) образцов.
Приготовление библиотек для TGS Включает выборочное удаление коротких фрагментов (очистка на магнитных микросферах) и присоединение специфических адаптеров, например, SMRTbell (PacBio) или шпилечных (Nanopore).
Для очистки библиотек подходят микросферы производства Yeasen Hieff NGS® DNA selection Beads DNA 12601ES. Они представляют собой альтернативу Ampure XP.
В основе действия данных магнитных частиц лежит принцип SPRI (твердофазная обратная иммобилизация), они применяются для очистки ДНК и выбора размера во время подготовки библиотек секвенирования следующего поколения. Данные микросферы совместимы с различными наборами для подготовки библиотек ДНК и РНК и являются хорошей альтернативой Ampure XP.
Наборы для фрагментации и лигирования ампликонов:
Модуль концевого восстановления и лигирования ампликонов Hieff для ONT
Модуль фрагментации и лигирования плазмид Hieff LongSeq
Реагент для фрагментации ДНК Hieff для ONT
Также производитель предлагает наборы для лигирования адаптеров для секвенаторов CycloneSEQ и ONT:
Модуль Hieff® DNA Endprep & A-Tail для ONT
Модуль лигирования штрихкодов Hieff NGS®для ONT для CycloneSEQ
Hieff™ LongSeq Набор для подготовки библиотек кДНК для CycloneSEQ
Модуль лигирования адаптеров Hieff (для секвенирования длинных прочтений) для ONT
Набор для подготовки ДНК-библиотек Hieff для ONT
Набор нативных баркодов Hieff, набор 1 (для секвенирования длинных прочтений) для ONT Информация для заказа
|