Реагенты для электрофореза в агарозных гелях

• Агароза для электрофореза
• Буферы для электрофореза в агарозных гелях
• ДНК маркеры
• Красители для электрофореза в агарозных гелях

Электрофорез ДНК в агарозном геле — аналитический метод, применяемый для разделения фрагментов ДНК по длине, основанный на разной скорости движения фрагментов разной длины при движении в геле под действием внешнего электрического поля.

ления фрагментов ДНК разной длины используют гель с различной концентрацией агарозы.

Чем меньше длина разделяемых фрагментов ДНК, тем больше должна быть концентрация агарозы.

Перед началом электрофореза к образцам принято добавлять два разных красителя с кислым значением pH (часто для этих целей используют ксиленовый голубой и бромфеноловый синий), чтобы визуализировать ход электрофореза и утяжелять образцы глицерином (до 20 % глицерина в образце).

Электрофорез проводится в камере, заполненной буферным раствором.

Чаще всего используются буферы, содержащие ЭДТА, трис, а также борную или уксусную кислоты.

Соответственно, буфер, содержащий борную кислоту, называется TBE (tris-borate-EDTA), а буфер, содержащий уксусную кислоту, — TAE (tris-acetate-EDTA).

Буфер необходим для повышения ионной силы раствора, в котором будет происходить разделение молекул ДНК под действием приложенного электрического поля.

После разделения фрагменты ДНК разной длины визуализируют при помощи флюоресцентных красителей, специфично взаимодействующих с ДНК, например, агарозные гели обычно красят бромистым этидием, который интеркалирует между азотистыми основаниями дуплекса и флюоресцирует в УФ-лучах.

Определение размеров производят путём сравнения наборов коммерческих фрагментов ДНК известной длины («DNA ladder») и ДНК в образцах. 

Реагенты, необходимые для проведения электрофореза в агарозном геле:

- Агароза

- Буферы

- ДНК и РНК-маркеры 

- Красители: броммфеноловый синий, ксиленовый голубой, бромистый этидий

Наименование	Объем	Производство	Метод	Кат.Номер
Ethidium bromide		HIMEDIA		RM813-1G
Бромистый этидий, 10 мг/мл, 10 мл (+4°)		БИОЛАБМИКС		BiolabMix_EtBr-10
Бромистый этидий, краситель для молекулярной биологии	1 г	Diagen		932400.1
Бромфеноловый синий Hi-Cert™/ACS	5 г	HIMEDIA		GRM117-5G
Бромфеноловый синий, чда	10 г	Diagen		3564.0010
Этидиум бромид, ≥95%	5 г	HIMEDIA		RM813-5G