Наборы для отбора фрагментов по длине Rebeads
Отбор фрагментов по длине (size selection) при подготовке библиотек для секвенирования — это удаление слишком коротких или слишком длинных молекул ДНК/РНК. Этот этап крайне важен, так как размер фрагментов напрямую влияет на качество прочтения (кластеризацию, длину прочтений).
Отбор фрагментов по длине на магнитных частицах (SPRI-селекция) — это наиболее популярный и гибкий метод отбора фрагментов. Метод основан на обратимом связывании нуклеиновых кислот с парамагнитными частицами в присутствии полиэтиленгликоля (ПЭГ) и соли. Варьируя концентрацию реагентов, можно точно отсекать слишком длинные или короткие фрагменты ДНК.
Принцип метода
- Механизм связывания: В условиях высокой ионной силы молекулы ДНК осаждаются на поверхности магнитных частиц. Чем длиннее молекула ДНК, тем легче она осаждается при более низкой концентрации ПЭГ.
- Высокая точность: Изменяя соотношение объемов магнитных частиц и образца (Volume Ratio, \(R\)), можно управлять порогом длины отсечения молекул в растворе.
Информация для заказа
|
