Наборы реагентов «ФИТОСКРИН» для выявления фитопатогенов методом ПЦР в реальном времени

Наборы реагентов «ФИТОСКРИН» для выявления фитопатогенов методом ПЦР в реальном времени

«ФИТОСКРИН» — стремительно развивающаяся технология быстрой молекулярно-генетической диагностики заболеваний растений методом ПЦР в реальном времени.

Технология состоит из 3-х основных этапов:

I этап

Предварительная подготовка и выделение ДНК/РНК: использование оригинальных реагентов и сорбирующих частиц в наборах для выделения НК обеспечивает получение максимального количества чистой ДНК/РНК и позволяет автоматизировать процесс выделения нуклеиновых кислот.

Для эффективной гомогенизации растительных образцов мы предлагаем набор реагентов «ФитоСорб-П», содержащий пробирки с экстрагирующим буфером и керамическими шариками для гомогенизации на гомогенизаторе Precellys Evolution или аналогичных.

Набор реагентов «Фитоскрин-Экспресс» поддерживает тенденцию к автоматизации лабораторного процесса и позволяет увеличить пропускную способность диагностических лабораторий путем выделения нуклеиновых кислот из растительного материала как ручным способом, так и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System или/и их аналогах. «Фитоскрин-Экспресс» 96 образцов – 36 минут.

Преимущества:

1. Качество и эффективность выделения НК
2. Время выделения НК
3. Минимальный расход пластика при выделении НК
4. Стоимость наборов реагентов
5. Автоматизация выделения НК

1 — только для образцов с низким содержанием вторичных метаболитов (картофель, овощные)

2 — хорошо подходит для выделения высокобелковых и образцов с высоким содержанием вторичных метаболитов (бобовые, зерновые, виноград, плодово-ягодные)

3 — подходит для образцов с высоким содержанием вторичных метаболитов (виноград, плодово-ягодные)

4 — подходит для простых для выделения НК образцов (культуры грибов/бактерий, выделение ДНК из молодых листьев) НЕ ПОДХОДИТ ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ РНК ВИРУСОВ!

II этап

ПЦР в реальном времени: обнаружение ДНК/РНК фитопатогенов.

1. Реакции обратной транскрипции и ПЦР при выявлении РНК-содержащих вирусов и вироидов проводятся совместно в одной пробирке, что позволяет уменьшить вероятность ошибок при постановках реакций и контаминации, а также расход пластика
2. Наборы ПЦР-реагентов адаптированы для наиболее распространённых в России приборов для ПЦР в реальном времени («АНК-32/М/48» (ИАП РАН, Россия), «CFX-96» («BioRad», США), «Rotor Gene 6000/Q» (Qiagen), «DT Prime/Lite» («ДНК-технология», Россия), «LightCycler96» («Roche», Германия), «QuantStudio5» (Applied Biosystems™, США).
3. Чувствительность наборов реагентов составляет от 1 до 20 копий ДНК/кДНК на реакцию
4. Специфичность ПЦР-РВ подтверждена на большой выборке из близкородственных и сопутствующих организмов. Образцы получены из российских и международных коллекций микроорганизмов и вирусов, видовая принадлежность которых подтверждена секвенированием по Сенгеру
5. При разработке наборов реагентов ПЦР-РВ для выявления фитопатогенов проводится сравнение с рекомендованными EPPO и ВНИИКР праймерамиЧерным цветом выделена смесь «Ph.solani-ВПК» (ООО «Синтол»); красным и оранжевым системы праймеров и зондов рекомендуемые EPPO для диагностики Candidatus Phytoplasma solani, BNrt* и mapBN** соответственно.

* Angelini E., Luca Bianchi G. Filippin L., Morassutti C., Borgo M. A new TaqMan method for the identification of phytoplasmas associated with grapevine yellows by real-time PCR assay. Journal of Microbiological methods, 2007 Jan., 68(3): 613-622 (doi:10.1016/j.mimet.2006.11.015)

** Pelletier C., Salar P., Gillet J., Cloquemin G., Very P., Foissac X., Malembic-Maher S. Triplex real-time PCR assay for sensitive and simultaneous detection of grapevine phytoplasmas of the 16SrV and 16SrXII-A groups with an endogenous analytical control. Vitis, 2009, 48(2): 87–95.

III этап

Анализ результатов. Автоматическая обработка результатов анализа на приборах для ПЦР в реальном времени АНК 32/48 (ИАП РАН, Россия): программное обеспечение позволяет автоматически формировать протоколы исследований с интерпретацией полученных результатов.

Для упрощения работы и анализа результатов с использованием прибора для ПЦР в реальном времени «QuantStudio5» (Applied Biosystems™, США) Вы можете воспользоваться таблицами .xls для ввода и вывода данных по образцам (актуально для программ QuantStudio™ Design & Analysis Software v.1.5.1 и v.1.5.2) и программой запуска прибора.

*Карантинный патоген растений

Вы можете заказать азработку наборов реагентов для выявления интересующих Вас фитопатогенов.

Наименование	Объем	Производство	Метод	Кат.Номер
Набор реагентов для обнаружения видоспецифичной ДНК свиньи “Sus scrofa Ident RT“	50 тестов	Синтол		D-203
Набор реагентов “ЦитоСорб/CytoSorb” для выделения ДНК/РНК фитопатогенов из растительного сырья, включая сложные образцы	50 выдел	Синтол		EW-001
Набор реагентов «Barley stripe mosaic virus-РВ» для выявления РНК вируса штриховатой мозаики ячменя методом ОТ-ПЦР-РВ	100 реакций	Синтол		PH-034
Набор реагентов «Barley yellow dwart virus-РВ» для выявления РНК вируса жёлтой карликовости ячменя	100	Синтол	ПЦР в реальном времени	PH-017
Набор реагентов «Cercospora kikuchii-РВ» для выявления ДНК возбудителя пурпурного церкоспороза сои* Карантинный патоген растений	100	Синтол	ПЦР в реальном времени	PH-035
Набор реагентов «Pantoea stewartii-РВ» для выявленияДНК возбудителя бактериального вилта кукурузы* Карантинный патоген растений	100	Синтол	ПЦР в реальном времени	PH-004
Набор реагентов «Pseudomonas fuscovaginae-РВ»для выявления ДНК возбудителя бактериальной гниливлагалища листа пшеницы	100	Синтол	ПЦР в реальном времени	PH-039
Набор реагентов «Tobacco ringspot virus-РВ» для выявления РНК вируса кольцевой пятнистости табака методом ОТ-ПЦР-РВ	100 реакций	Синтол		PH-040
Набор реагентов «Wheat streak mosaic virus-РВ» для выявления РНК вируса полосатой мозаики пшеницы методом ОТ-ПЦР-РВ		Синтол		PH-049
Набор реагентов «Xanthomonas oryzae pv. oryzae-РВ»для выявления ДНК возбудителя бактериального ожогариса* Карантинный патоген растений	100	Синтол	ПЦР в реальном времени	PH-025
Набор реагентов «Фитоскрин-Экспресс»для выделения нуклеиновых кислот из растительного материала ручным способом и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System и/или их аналогах	96 реакций	Синтол		PH-524